В декларации за I квартал 2024 года, после прехода на ОСН, организация заявила НДС к возмещению, исчисленный в 2020 г.. Налоговики отказали: вычет применили по сделке с иностранной компанией зпо истечении 3-летнего срока.  Судами правомерно подтверждено право налогового агента на применение налогового вычета по НДС.  (Постановление АС Московского округа от 03.04.2026 по делу N А41-12847/2025)

Отказывая в возмещении НДС, налоговый орган указал на необоснованность применения налогового вычета из-за пропуска трехлетнего срока на подачу заявления на вычет. 

Однако Требование "О признании недействительным решения налогового органа в части отказа в возмещении НДС".судами удовлетворено, поскольку налогоплательщик в период возникновения права на применение соответствующих налоговых вычетов находился на упрощенной системе налогообложения и не имел возможности заявить сумму налога к возмещению.

Таким образом, для обоснованности применения налоговых вычетов по НДС необходимо соблюдение принципа документального подтверждения факта приобретения товаров (работ, услуг) и уплаты налога налоговыми агентами. 

На основании пункта 4 статьи 174 Кодекса уплата НДС налоговым агентом производится одновременно с выплатой денежных средств иностранному лицу, не состоящему на налоговом учете в налоговом органе и оказывающему указанные услуги (в редакции Кодекса действовавшей на момент возникновения). Суды исходили из того, что такие условия возникли не в налоговых периодах, в которых был отражен НДС к уплате, а в момент, когда налог был фактически уплачен (взыскан) в бюджет, т.е. в 3 квартале 2021 года. В I квартале 2024 года 3-летний срок на применение вычета еще не истек..